Kapucynka prowadzi głównie nadrzewny tryb życia.
Kapucynki żyją w grupach liczących około 3-30 osobników, z hierarchią określającą ich status społeczny. Samiec alfa broni swojego terytorium, jeśli zbliży się do innej grupy. Kapucynki spędzają dużo czasu na pielęgnowaniu siebie nawzajem w ramach socjalizacji, przy czym największą uwagę poświęcają tym, które są najwyżej w hierarchii. Pokrywają się własnym moczem, aby zaznaczyć swoje terytorium. Zapach wówczas podróżuje razem z nimi.
Kapucynki porozumiewają się, wydając krótkie i częste skamlania jak nowonarodzone szczenię. W niebezpieczeństwie emitują dwustopniowy stukot. Wiele odgłosów wydawanych przez kapucynki jest podobnych do odgłosów ptaków. Komunikują się również za pomocą sygnałów chemicznych, aby zaznaczyć granice terytoriów, a także podczas rytuałów godowych.
Kapucynki żółtobrzuche mają ubarwienie, które sprawia, że kamuflują się w swoim środowisku bardzo dobrze, co utrudnia ich wykrycie przez drapieżnika. Kiedy kapucynki przebywają na ziemi lub w pobliżu wody, mogą paść ofiarą drapieżników, takich jak węże, duże ptaki drapieżne, krokodyle lub duże ssaki mięsożerne. Im większa grupa, tym mniejsza szansa, że staną się ofiarą ze względu na większą czujność. Jeśli zostanie zauważony drapieżnik, kapucynka zaalarmuje innych za pomocą sygnału alarmowego. Kapucynki mają wyostrzony zmysł węchu, który pomaga im rozróżniać ślady zapachowe pozostawione przez inne stada kapucynek.
Kapucynki mogą rozmnażać się przez cały rok, ale samice rodzą co dwa lata. Ciąża trwa 150-180 dni i rodzi jedno młode. Noworodki są w 100% zależne od swoich matek przez pierwszy rok życia i uzyskują niezależność po około 6-12 miesiącach. Samice kapucynek osiągają dojrzałość około 4-5 roku życia i rozpoczynają krycie i rodzenie w wieku 7-8 lat. Samce osiągają dojrzałość i są płodne około 6-8 roku życia.
Kapucynki łączą się w pary z więcej niż jednym partnerem. Samiec alfa w grupie zawsze ma pierwszy wybór, która samica będzie jego partnerką. Pozostałe samce z tej grupy są również aktywne seksualnie, ale samiec dominujący ma największy sukces reprodukcyjny. Samiec alfa jest najbardziej pożądany przez samice, ponieważ zapewni największą ochronę swoim młodym. Unikalne rytuały godowe mają na celu przyciągnięcie samicy przez samca. Najpierw samica podnosi brwi i porusza głową w przód i w tył. Dotyka go i ucieka, mamrocząc dźwięki. Samiec nawiązuje z nią kontakt wzrokowy, a także wydaje dźwięki. Pojawia się taniec czyli podskoki i wirowanie w powietrzu. Zaraz po kryciu para kontynuuje taniec przez kilka sekund.
Żywotność kapucynek w naturze wynosi około 15-25 lat. W hodowlach zamkniętych mogą żyć znacznie dłużej, do około 50 lat.